在有机合成反应机理学习中，有很多学生分不清楚中间体和过渡态的概念和界限。事实上反应过渡态和反应中间体在能量、稳定性、可检测性等方面存在本质区别。可谓是有机反应机理中两个不太相关的核心概念，借此，我们在公众号里做个总结：反应过渡态是反应进程中能量最高的瞬时结构，能量高于反应物和产物，处于能垒顶端。是反应物转化为产物的必经能垒，决定反应速率与决速步，控制立体化学与区域选择性。它极不稳定，无法分离，理论上为零时间，仅存在于量子力学描述的瞬态。结构上正如同生长的胚胎期，要形成新键但路程还没走完，键处于断裂 / 形成的过渡状态（如部分成键的 “半键”），具有部分电荷或自由基特征。
反应过渡决定反应的活化能和速率，是机理推导的关键理论模型。
反应中间体能量低于过渡态，是反应过程中生成的具有有限寿命的物种，位于两个过渡态之间的能量低谷，这种物种只限于某些特定的反应，并不是每种反应都存在的。如类似SN2（双分子亲核取代）的协同机制，就没有反应中间体存在。
中间体相对稳定，寿命从纳秒到小时不等，稳定的比如格式试剂，有机锂试剂，TEMPO；不稳定的比如卡宾，碳正离子，奶春，自由基等。但即使不是太稳定的结构，我们也可以通过创造条件去尝试捕获观察。如碳正离子这种高活性中间体，便可通过超酸稳定（SbF₅/HSO₃F 体系）通过低温NMR来检测。
中间体具有完整化学键，作为反应的中间物种，参与后续步骤，影响产物选择性，如共轭烯烃与氢溴酸加成时，碳正离子的稳定性；烯烃的亲电加成反应
总体上看过渡态是 “反应路径的咽喉”，决定能垒高低，主要是动力学模型；中间体是 “反应的中间站”，影响路径分支，主要受热力学模型控制。
